含暂停的转录延伸过程的最小模型
定量方法
2019-08-15 v1 亚细胞过程
摘要
转录和翻译等基本生物过程，其中遗传序列由大分子依次读取，已被非平衡统计物理的经典模型——完全非对称排斥过程（TASEP）很好地描述。该模型描述了粒子在一维晶格位点之间的跳跃，粒子流决定了转录或翻译速率。一个开放性问题是如何分析粒子可以随机暂停的 TASEP，正如转录过程中所观察到的那样。在这项工作中，我们报告说，令人惊讶地，一个简单的平均场模型使用对暂停粒子后方阻塞的简单描述，就能很好地预测所有平均暂停时长下的粒子流。
引用
@article{arxiv.1411.4978,
title = {Minimal model of transcriptional elongation processes with pauses},
author = {Jingkui Wang and Benjamin Pfeuty and Quentin Thommen and Carmen Romano and Marc Lefranc},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.4978},
year = {2019}
}