蛋白质折叠与动力学陷阱的主方程方法
统计力学
2009-10-31 v2 高能物理 - 格点
生物物理
q-bio
摘要
我们数值求解了12单体格点杂聚物的主方程,并确定了天然态占据数的时间演化。在低温下,中位折叠时间遵循阿伦尼乌斯定律,并由最长的弛豫时间所支配。对于好的折叠子,折叠漏斗中会出现显著的动力学陷阱,而对于差的折叠子,陷阱也会出现在非天然的能谷中。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9803019,
title = {Master equation approach to protein folding and kinetic traps},
author = {Marek Cieplak and Malte Henkel and Jan Karbowski and Jayanth R. Banavar},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9803019},
year = {2009}
}
备注
4 pages, Latex, 3 figures as uuencoded ps files