IntelliCircos：一个数据驱动且基于 AI 的 Circos 绘图 authoring 工具
人机交互
2025-04-01 v1
摘要
基因组数据是生物医学领域的必需品，生信分析师通常手动创建 circos 图来分析数据并提取有价值的见解。然而，创建 circos 图比较复杂，因为需要为多个轨道属性和它们之间的位置关系进行精心设计。通常情况下，分析师会寻求现有 circos 图的灵感，并且必须反复调整和细化图表以实现满意的最终设计，这使得该过程既繁琐又耗时。为此，我们提出了 IntelliCircos，一个 AI 驱动的交互式 authoring 工具，可从初始视觉设计到最终实现 circos 图进行 streamlining。具体而言，我们构建了一个包含 4396 个带相应注释和配置的 circos 图数据集，这些数据集从已发表的论文中提取并标记。在数据集的帮助下，我们进一步识别了轨道组合模式，并利用大型语言模型（LLM）提供领域特定的设计建议和配置参考，以指导 circos 图的设计。我们对 8 名生信分析师进行的用户研究，以评估 IntelliCircos 的可用性和效果，结果表明其在 circos 图 authoring 中具有良好的可用性和效果。
引用
@article{arxiv.2503.24021,
title = {IntelliCircos: A Data-driven and AI-powered Authoring Tool for Circos Plots},
author = {Mingyang Gu and Jiamin Zhu and Qipeng Wang and Fengjie Wang and Xiaolin Wen and Yong Wang and Min Zhu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2503.24021},
year = {2025}
}