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Gosling Designer: democratizing genomics data visualization tools construction与分享的平台

基因组学 2025-12-02 v2

摘要

基因组数据分析是现代生物学几乎所有领域的核心环节。尽管人工智能(AI)和计算方法取得了显著进展,但这些技术仍需大量人工监督才能生成新颖且可靠的生物学见解。因此,基因组学社区发展出了大量多样化的可视化方法,以及众多生物学家依赖的分析工具。虽然已有少数常用工具用于基因组数据可视化,但许多工具针对特定的基因组数据解读场景,仅提供有限且预定义的可视化类型。此外,静态可视化往往难以支持探索性分析。开发交互式可视化工具通常需要大量时间和技术专长,即便借助现代大语言模型(LLM) powered coding助手,也会导致最终可视化工具难以在合作者之间共享。我们开发了Gosling Designer,一个用于编辑、探索和分享基因组数据可视化的全能平台。Gosling Designer 旨在解决现有基因组可视化工具中观察到的四个关键挑战:(1)功能局限,(2)可视化 authoring 的困难,(3)数据管理的复杂性,(4)分享与协作的障碍。

关键词

引用

@article{arxiv.2510.24888,
  title  = {Gosling Designer: a Platform to Democratize Construction and Sharing of Genomics Data Visualization Tools},
  author = {Sehi L'Yi and John Conroy and Priya Misner and David Kouřil and Astrid van den Brandt and Lisa Choy and Nezar Abdennur and Nils Gehlenborg},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2510.24888},
  year   = {2025}
}