基于匹配与错配比对信息识别 DNA 模体
定量方法
2014-03-03 v2 基因组学
摘要
仅基于匹配比对信息识别 DNA 模体的传统方法容易产生大量伪位点。通过同时考虑匹配与错配比对信息，本文引入了一种新的评分系统。错配比对信息有助于去除 DNA 模体搜索中遇到的伪位点。作为一个例子，基于匹配与错配比对信息，已成功识别出 Homo sapiens H4/g 基因中一个正确的 TATA 盒位点。
引用
@article{arxiv.1402.5348,
title = {Identifying DNA motifs based on match and mismatch alignment information},
author = {Jian-Jun Shu and Kian Yan Yong},
journal= {arXiv preprint arXiv:1402.5348},
year = {2014}
}