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一种利用逻辑匹配进行无比对序列比较的算法

计算工程、金融与科学 2014-07-09 v1 定量方法

摘要

本文提出了一种利用逻辑匹配进行无比对序列比较的算法。在此,我们使用模糊隶属度值来计算得分,这些值由匹配和错配的数量自动生成。我们用人工数据和真实数据演示了该方法。通过分析取自 NCBI 数据库的 DNA 序列并以新颖的计算时间进行分析,结果展示了所提方法的独特性。

关键词

引用

@article{arxiv.1407.2237,
  title  = {An Algorithm for Alignment-free Sequence Comparison using Logical Match},
  author = {Sanil Shanker KP and Elizabeth Sherly and Jim Austin},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1407.2237},
  year   = {2014}
}

备注

Computer and Automation Engineering (ICCAE), 2010 The 2nd International Conference on