单链DNA i-motif的高温解折叠模拟
生物物理
2011-03-31 v1 软凝聚态物质
计算物理
摘要
我们展示了DNA i-motif在500 K高温下的分子动力学模拟结果。其本质动力学和主要解折叠路径与300 K下的偏置元动力学模拟进行了比较。我们的结果表明,两种温度下的协同运动具有显著的一致性。该转变可以由少数几个特征向量描述,表明这是一个简单的解折叠过程。在500 K下可以检测到解折叠路径的两种主要机制,这与300 K下偏置模拟的结果吻合良好。
关键词
引用
@article{arxiv.1103.5932,
title = {High temperature unfolding simulations of a single stranded DNA i-motif},
author = {Jens Smiatek and Dongsheng Liu and Andreas Heuer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1103.5932},
year = {2011}
}
备注
7 pages, 7 figures