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单链DNA i-motif的高温解折叠模拟

生物物理 2011-03-31 v1 软凝聚态物质 计算物理

摘要

我们展示了DNA i-motif在500 K高温下的分子动力学模拟结果。其本质动力学和主要解折叠路径与300 K下的偏置元动力学模拟进行了比较。我们的结果表明,两种温度下的协同运动具有显著的一致性。该转变可以由少数几个特征向量描述,表明这是一个简单的解折叠过程。在500 K下可以检测到解折叠路径的两种主要机制,这与300 K下偏置模拟的结果吻合良好。

关键词

引用

@article{arxiv.1103.5932,
  title  = {High temperature unfolding simulations of a single stranded DNA i-motif},
  author = {Jens Smiatek and Dongsheng Liu and Andreas Heuer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1103.5932},
  year   = {2011}
}

备注

7 pages, 7 figures