图的拓扑与图上自旋模型的自由能
统计力学
2017-03-01 v1 生物大分子
摘要
在这项工作中，我们证明了图的拓扑与图上自旋系统的自由能之间存在直接关系。我们开发了一种将自由能中的拓扑贡献与焓贡献分离的方法，并发现在高温下，即使能量学不完全已知，仅考虑拓扑也足以对不同图系统的自由能进行定性比较。该方法被应用于含缺陷的金属晶格系统，我们发现它部分解释了为什么点缺陷比高维缺陷更稳定。给定能量学后，我们甚至可以通过线性图贡献的闭合形式定量比较不同图结构的自由能。该闭合形式被用于预测晶格蛋白质的序列空间自由能，这是决定蛋白质结构可设计性的关键因素。
引用
@article{arxiv.1611.09483,
title = {Graph's Topology and Free Energy of a Spin Model on the Graph},
author = {Jeong-Mo Choi and Amy I. Gilson and Eugene I. Shakhnovich},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.09483},
year = {2017}
}