巨型枢纽Src和Syk酪氨酸激酶热力学谱重现演化历程
其他定量生物学
2017-05-24 v1
摘要
热力学标度理论,先前主要应用于小蛋白,在此用于分析标题所述功能网络巨型枢纽酶的定量演化。通过同源性鉴定的广泛结构域结构,仅使用氨基酸序列就得到了亲水性确认。最令人惊讶的结果涉及酪氨酸激酶球状表面粗糙度从鸟类到哺乳动物的演化,这是一级相变,而哺乳动物内部从啮齿类到人类的演化则是二级相变。原癌基因酪氨酸蛋白激酶独特的酰胺末端区域的奥秘,通过在此发现一个七联体靶向簇得以解开,与之平行的是人类和其他少数物种中酪氨酸激酶的一个八联体催化簇。这些结果在很大程度上解释了为什么这些蛋白质是蛋白质相互作用网络中最大的巨型枢纽之一,且未使用任何可调参数。
引用
@article{arxiv.1610.04656,
title = {Giant Hub Src and Syk Tyrosine Kinase Thermodynamic Profiles Recapitulate Evolution},
author = {J. C. Phillips},
journal= {arXiv preprint arXiv:1610.04656},
year = {2017}
}
备注
18 pages, 8 figures