自组织网络:肌球蛋白-1 的达尔文式进化
其他定量生物学
2020-11-04 v1 软凝聚态物质
生物物理
摘要
细胞骨架是基于聚合蛋白(肌动蛋白、微管蛋白)并由马达蛋白(如肌球蛋白、驱动蛋白和动力蛋白)驱动的自组织网络。其正向达尔文式进化使它们趋近优化功能(自组织临界性)。细胞骨架马达蛋白肌球蛋白-1 的真核进化主要特征与肌动蛋白和微管蛋白相似,但也显示出与其动力学功能相关的显著差异。优化的(长)疏水波表征了朝向优化功能(自组织临界性)的分子水平达尔文式进化。肌球蛋白-1 的 N 端和中央结构域在真核生物中以不同速率进化,其中央结构域疏水极值在人类中活性最优。一项测试表明,疏水标度在接近优化功能处可产生优于 1% 的精度。朝向同步水平极值的进化与 Mys-1 在人类中涉及高尔基复合体的特殊功能相关。
引用
@article{arxiv.2011.01873,
title = {Self-Organized Networks: Darwinian Evolution of Myosin-1},
author = {J. C. Phillips},
journal= {arXiv preprint arXiv:2011.01873},
year = {2020}
}
备注
20 pages, 9 figures