序列与结构之辨:演化视角下的蛋白质热稳定性策略
生物大分子
2007-05-23 v2 种群与进化
摘要
本工作中我们采用多种分析方法(展开模拟以及嗜热生物蛋白质组的序列与结构比较分析)表明,生物可遵循两种主要的嗜热适应策略:(i) 通用的、非特异的、基于结构的策略,某些嗜热生物的蛋白质组显示出向更高紧凑度蛋白质的显著结构偏向。此时热稳定性由更多总体稳定接触数实现,其中无一特别强;以及(ii) 特异的、基于序列的策略,即在不显著改变蛋白质结构的情况下应用旨在加强特定类型相互作用(如静电)的序列变异。特定策略的选择是特定(超)嗜热物种演化历史与环境条件的直接后果:直接在热环境中演化的古老超嗜热生物主要采取基于结构的策略,而后来演化、其嗜热适应为重新定殖热环境后果的生物则采取特异的、基于序列的嗜热适应策略。
引用
@article{arxiv.q-bio/0408007,
title = {Of sequence and structure: Strategies of protein thermostability in evolutionary perspective},
author = {Igor N. Berezovsky and Eugene I. Shakhnovich},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0408007},
year = {2007}
}
备注
41 pages, 4 figures, 3 tables. Submitted