Kimura 三参数模型的几何
代数几何
2007-05-23 v1 交换代数
种群与进化
摘要
带有 n 个叶的树上的 Kimura 三参数模型是系统发育学中使用最多的模型之一。与之相关的仿射代数簇 W 是一个环面簇。我们研究其几何，并证明它同构于仿射空间被作用其上的有限群所给出的几何商。作为推论，我们得以研究 W 的奇点，并证明具有生物学意义的点是光滑点。接着我们给出一个算法，对任意叶数 n，在这些点处构造局部化理想的一组极小生成元。这导致基于代数几何的系统发育重建方法的重大改进。
引用
@article{arxiv.math/0702834,
title = {Geometry of the Kimura 3-parameter model},
author = {Marta Casanellas and Jesus Fernandez-Sanchez},
journal= {arXiv preprint arXiv:math/0702834},
year = {2007}
}
备注
26 pages with 4 figures