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RNA 扩展矩阵模型的属分布

统计力学 2008-04-23 v2 软凝聚态物质 生物大分子

摘要

我们构建并研究了一种 RNA(聚合物)折叠的扩展随机矩阵模型。在 RNA 配分函数的作用量中加入了一个作用于链中所有核苷酸的微扰。研究了该微扰对配分函数和属分布的影响。该微扰区分了配对碱基和未配对碱基。例如,对于 α=1\alpha = 1(其中 α\alpha 是作用量中原始项与微扰项强度之比),奇数长度的配分函数和属分布完全消失。对于偶数长度,配分函数和属分布非零,此时仅保留完全配对碱基的结构。这意味着:(i) 属分布是不同的;(ii) 在扩展矩阵模型中,随着 α\alpha 趋近于 1,存在一种“结构相变”(从“未配对 - 配对碱基相”到“完全配对碱基相”)。我们将扩展 RNA 模型的结果与 G. Vernizzi、H. Orland 和 A. Zee 在 PRL 94, 168103(2005) 中的结果进行了比较。

关键词

引用

@article{arxiv.0802.2440,
  title  = {Genus Distributions For Extended Matrix Models Of RNA},
  author = {Itty Garg and N. Deo},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0802.2440},
  year   = {2008}
}

备注

15 pages, 4 figures, 3 tables