DNA 断裂的统计力学：理论与模拟

我们研究了剪切力对双链 DNA 断裂机制的影响。受近期实验的启发，我们进行了包含显式溶剂的原子尺度模拟，以获得断裂力以下氢键和共价键伸长量的分布。我们发现原子尺度模拟结果与文献中基于粗粒化模型（理论和模拟）的现有结果存在显著差异。我们讨论了可能的原因，并通过在其描述中纳入核苷酸的半微观细节后果，改进了粗粒化模型。经修正模型（模拟和理论）获得的分布与使用原子尺度模拟获得的分布在定性上相似。