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单链和双链DNA构象转变的可控准则

软凝聚态物质 2007-05-23 v1 生物物理 化学物理 生物大分子

摘要

无论是生物或合成的,链状大分子在溶液中都会在温度或溶剂条件改变时,从空间扩展构象转化为紧凑构象。这种尖锐转变在DNA凝聚、蛋白质折叠以及聚合物溶液行为等各种现象中发挥着关键作用。在DNA凝聚等生物过程中,折叠可通过少量加入的分子敏感地诱导。本文推导了此类试剂对构象转变影响的通用准则。我们发现, Depending on链刚性,存在两种不同情形。如果持久长度——即链沿方向保持特性的特征长度——小于由试剂诱导的吸引性关联范围(通常为几纳米),则链逐渐收缩。刚性更大的链发生尖锐折叠。我们由此建议,双链DNA相对于单链DNA具有更高刚性,是实现尖锐、可控构象转变的必要条件。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0109253,
  title  = {General criterion for controllable conformational transitions of single and double stranded DNA},
  author = {H. Diamant and D. Andelman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0109253},
  year   = {2007}
}

备注

12 pages, PDF