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分子与 DNA 及其他准刚性聚合物的结合

软凝聚态物质 2009-09-25 v3 生物物理 化学物理 生物大分子

摘要

本文提出了一种小分子(如表面活性剂)与准刚性聚合物结合的理论模型。假设该聚合物的持久长度大于单体尺寸,但远小于链的总长度。此类聚合物(如 DNA)处于灵活聚合物与刚性棒状聚合物之间的中间情况,其与小分子结合的关联效应先前已被研究。链的柔性不足以主动参与自组装,但其波动会导致结合分子之间存在较长程的相互吸引作用。在结合显著影响局部链刚性的情况下,这些相互作用会导致非常尖锐、协arty的结合。这一情景与 DNA 与表面活性剂以及诸如 RecA 等紧凑蛋白的结合相关。对链施加的外向张力被发现会显著修改结合行为,通过抑制波动诱导的相互作用来实现。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/9910162,
  title  = {Binding of molecules to DNA and other semiflexible polymers},
  author = {Haim Diamant and David Andelman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9910162},
  year   = {2009}
}

备注

15 pages, 7 figures, RevTex, the published version