分子与 DNA 及其他准刚性聚合物的结合
软凝聚态物质
2009-09-25 v3 生物物理
化学物理
生物大分子
摘要
本文提出了一种小分子(如表面活性剂)与准刚性聚合物结合的理论模型。假设该聚合物的持久长度大于单体尺寸,但远小于链的总长度。此类聚合物(如 DNA)处于灵活聚合物与刚性棒状聚合物之间的中间情况,其与小分子结合的关联效应先前已被研究。链的柔性不足以主动参与自组装,但其波动会导致结合分子之间存在较长程的相互吸引作用。在结合显著影响局部链刚性的情况下,这些相互作用会导致非常尖锐、协arty的结合。这一情景与 DNA 与表面活性剂以及诸如 RecA 等紧凑蛋白的结合相关。对链施加的外向张力被发现会显著修改结合行为,通过抑制波动诱导的相互作用来实现。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9910162,
title = {Binding of molecules to DNA and other semiflexible polymers},
author = {Haim Diamant and David Andelman},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9910162},
year = {2009}
}
备注
15 pages, 7 figures, RevTex, the published version