DNA构象变化对大分子形变分量耦合的影响
软凝聚态物质
2020-12-01 v1 生物物理
摘要
考虑到两类形变分量——外部与内部，建立了 DNA 大分子的形变模型。外部分量描述双螺旋的弯曲、扭转与拉伸。内部分量为双螺旋内部的构象迁移性。本工作考虑 DNA 大分子形变时外部（形变）分量与内部（构象变化）分量的耦合。在问题考量中，计入了大分子扭转-拉伸耦合以及扭转与内部分量间的耦合。在此条件下得到的形变分量解，可改变拉伸分量对解旋（过旋）的响应特征，该特征依赖于施加于扭转分量的力。从单分子实验中已知，在达到临界解旋力时形变特征由压缩变为拉伸（反之在临界拉伸力时由过旋变为解旋）。本工作通过引入内部分量，阐明了双螺旋此种反常行为的本质。所得解及其与实验结果的一致性表明，在 pN 量级外力作用下，双螺旋构象力学中内部与外部分量的耦合起着重要作用。
引用
@article{arxiv.2011.14772,
title = {The effect of DNA conformation changes on the coupling of the macromolecule deformation components},
author = {P. P. Kanevska and S. N. Volkov},
journal= {arXiv preprint arXiv:2011.14772},
year = {2020}
}