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构象对DNA TATA-box变形的影响

生物物理 2024-06-19 v1

摘要

本文对DNA双螺旋特殊序列TATA-box的可变形性进行了理论研究。论文详细阐述了DNA TATA-box双螺旋异常变形的机制,这些机制无法用聚合物分子的标准力学模型(WLC)解释,需要更细致的建模。通过分析DNA TATA-box的变形,表明该分子可因其结构多态性(即双螺旋片段可以存在于多于一种构象中的可能性)而发生显著变形。除弹性分量(弯曲、扭转)外,所提出的模型还包括以下变形特征:糖环形状发生构象重排的可能性、特定核苷酸序列的影响和各向异性、各分量之间的耦合。所提出的模型能够基于双螺旋内部结构的物理特殊特征描述异常变形。

关键词

引用

@article{arxiv.2012.03696,
  title  = {Conformational impact on deformation of DNA TATA-box},
  author = {P. P. Kanevska and S. N. Volkov},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2012.03696},
  year   = {2024}
}