基于 Jarzynski 等式的聚合物易位自由能评估
统计力学
2015-06-18 v2 软凝聚态物质
摘要
借助云计算资源，我们进行了广泛的 Langevin 模拟，为无偏三维聚合物易位提供自由能估计。我们在严格设定下采用 Jarzynski 等式，计算单个单体易位事件中的自由能变化。在我们的三维 Langevin 模拟中，珠子（单体和膜原子）之间的排除体积和范德华相互作用通过排斥性 Lennard-Jones (LJ) 势进行建模，连续单体则受有限延伸非线性弹性 (FENE) 势作用。通过分析不同长度聚合物的数据，发现自由能剖面具有有趣的有限尺寸标度特性。
引用
@article{arxiv.1401.8040,
title = {Free Energy Evaluation in Polymer Translocation via Jarzynski Equality},
author = {Felipe Mondaini and Luca Moriconi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1401.8040},
year = {2015}
}
备注
14 pages, 5 figures, Accepted for publication in Physics Letters A