聚合物进出椭球腔的易位
软凝聚态物质
2015-05-20 v1
摘要
采用蒙特卡洛模拟研究聚合物通过窄孔进出椭球腔的易位。我们测量了聚合物自由能 F 随易位坐标 s 的函数,s 定义为已进入腔内的键数。为研究聚合物插入,我们考虑了作用于孔内单体的驱动力以及单体对腔壁的吸引。我们考察了当腔体形状各向异性、体积、聚合物长度以及驱动插入的相互作用强度变化时 F(s) 的改变。对于无热系统,采用标度方法分析自由能函数,将聚合物的受限部分视为半稀区。将自由能函数与 Fokker-Planck 方程结合以测量平均易位时间以及易位时间分布。我们发现,对于椭球腔,聚合物的喷出与插入均比球腔更快。结果与朗之万动力学研究在喷出情形下定性一致,但在插入情形下不一致。该差异可能源于 FP 方法未考虑的非平衡构象行为。
引用
@article{arxiv.1502.05737,
title = {Polymer translocation into and out of an ellipsoidal cavity},
author = {James M. Polson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1502.05737},
year = {2015}
}
备注
11 pages, 11 figures