基于朗之万动力学通过膜介导相互作用计算粒子自由能
数值分析
2020-10-01 v1 数值分析
计算物理
摘要
我们应用已建立的朗之万采样概念，推导了一类新算法，用于高效计算嵌入“快速”膜中的涨落粒子的自由能差，即一种瞬时适应粒子位置变化的膜。在膜中粒子的变分混合模型框架下，推导了描述膜介导粒子相互作用的几何势。近期几何相互作用势梯度的显式表示使得应用已知的基于梯度的马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）方法（如基于朗之万的采样）成为可能。
引用
@article{arxiv.2009.14713,
title = {Free energy computation of particles with membrane-mediated interactions via Langevin dynamics},
author = {Tobias Kies and Carsten Gräser and Luigi Delle Site and Ralf Kornhuber},
journal= {arXiv preprint arXiv:2009.14713},
year = {2020}
}