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分形球状体作为人工分子机器

统计力学 2015-06-15 v4 生物物理

摘要

研究了由分形(皱缩)聚合物球状体的接触图构建的弹性网络的弛豫过程。我们发现:i) 网络的最慢模式与谱的其余部分被一个宽能隙隔开;ii) 网络迅速弛豫到由最慢自由度张成的低维(在我们的演示中为一维)流形上,该流形具有较大的吸引盆,随后缓慢趋近平衡态且不脱离该流形。凭借这些动力学特性,分形球状体弹性网络类似于真实的生物分子机器,如肌球蛋白。我们证明了分形球状体的展开可以描述为层级系统中的级联平衡相变。展开表现为随温度变化而发生的层级稳定性顺序丧失。

关键词

引用

@article{arxiv.1303.3898,
  title  = {Fractal globule as an artificial molecular machine},
  author = {V. A. Avetisov and V. A. Ivanov and D. A. Meshkov and S. K. Nechaev},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1303.3898},
  year   = {2015}
}

备注

6 pages, 5 figures (including Supplementary materials)