胰腺癌微环境的形式化建模与分析
定量方法
2016-06-13 v1
摘要
胰腺癌研究的重点已从胰腺癌细胞转向其微环境，该微环境涉及与癌细胞相互作用并影响肿瘤进展的胰腺星状细胞。为了定量理解胰腺癌微环境，我们构建了一个用于癌细胞和星状细胞的胞内信号网络及其细胞间通讯的计算模型。我们扩展了基于规则的 BioNetGen 语言，分别使用离散和连续变量来描述胞内和胞间动力学。我们的框架还支持统计模型检验程序，用于分析系统在各种扰动下的行为。结果通过识别与现有实验观察一致的重要系统特性，展示了我们模型的预测能力。我们还获得了关于胰腺癌新型治疗策略发展的有趣见解。
引用
@article{arxiv.1606.03138,
title = {Formal Modeling and Analysis of Pancreatic Cancer Microenvironment},
author = {Qinsi Wang and Natasa Miskov-Zivanov and Bing Liu and James R. Faeder and Michael Lotze and Edmund M. Clarke},
journal= {arXiv preprint arXiv:1606.03138},
year = {2016}
}