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一种刻画肿瘤微环境中肿瘤-免疫空间关系的新型框架

定量方法 2022-05-03 v3 计算机视觉与模式识别 图像与视频处理

摘要

理解肿瘤生物学对邻近细胞组成的影响,往往需要刻画生物学上不同的肿瘤区域所产生的作用。已有生物标志物被用于标记生物学上不同的肿瘤区域,但由于不同标记区域在空间范围与分布上存在差异,由此带来诸多挑战。本工作中,我们提出一种框架,用于系统研究不同肿瘤区域对肿瘤边界附近细胞的影响,并考虑它们的交叉空间分布。我们将该框架应用于胰腺癌的多重免疫组化(mIHC)研究,证明其能有效展示生物学上不同的肿瘤区域如何影响肿瘤微环境中的免疫应答。此外,我们表明所提框架可扩展至大规模全切片图像分析。

关键词

引用

@article{arxiv.2204.12283,
  title  = {A Novel Framework for Characterization of Tumor-Immune Spatial Relationships in Tumor Microenvironment},
  author = {Mahmudul Hasan and Jakub R. Kaczmarzyk and David Paredes and Lyanne Oblein and Jaymie Oentoro and Shahira Abousamra and Michael Horowitz and Dimitris Samaras and Chao Chen and Tahsin Kurc and Kenneth R. Shroyer and Joel Saltz},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2204.12283},
  year   = {2022}
}