时序网络上 SIR 模型的快速且严谨的模拟
物理与社会
2021-06-09 v3 定量方法
摘要
易感-感染-恢复（SIR）模型是描述感染后在恢复后获得免疫力的传染病的经典模型。计算流行病学中的许多开放问题涉及底层接触结构对 SIR 等模型的影响。时序网络构成了一个理论框架，能够同时编码谁可能感染谁的网络结构以及这些接触发生的时间。在本文中，我们讨论了此类模拟背后的详细假设——如何使其与解析可处理的 SIR 模型表述具有可比性，同时尽可能真实。我们还为此目的提出了一个高度优化的开源代码，并讨论了使程序尽可能快所需的所有步骤。
引用
@article{arxiv.2007.14386,
title = {Fast and principled simulations of the SIR model on temporal networks},
author = {Petter Holme},
journal= {arXiv preprint arXiv:2007.14386},
year = {2021}
}