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人类蛋白质同源网络中的爆炸性渗流

分子网络 2015-05-14 v1 无序系统与神经网络 统计力学 种群与进化

摘要

我们研究了真实世界网络中渗流转变的爆炸性特征。我们表明,人类蛋白质同源网络 (H-PHN) 中跨越簇的出现表现出与 Achlioptas 过程相似的特征,并且与常规随机渗流显著不同。这种转变的潜在机制可以用缓慢增长的簇来描述,这些簇在过程的后期阶段之前一直保持孤立,此时添加少量链接会导致这些模块快速互连成一个巨型簇。我们的结果表明,通过复制-发散事件塑造 H-PHN 拓扑的基于进化的过程可能以突然的步骤发生,类似于在一级相变中观察到的情况。

关键词

引用

@article{arxiv.0911.4082,
  title  = {Explosive Percolation in the Human Protein Homology Network},
  author = {Hernán D. Rozenfeld and Lazaros K. Gallos and Hernán A. Makse},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0911.4082},
  year   = {2015}
}

备注

13 pages, 6 figures