人类蛋白质同源网络中的爆炸性渗流
分子网络
2015-05-14 v1 无序系统与神经网络
统计力学
种群与进化
摘要
我们研究了真实世界网络中渗流转变的爆炸性特征。我们表明,人类蛋白质同源网络 (H-PHN) 中跨越簇的出现表现出与 Achlioptas 过程相似的特征,并且与常规随机渗流显著不同。这种转变的潜在机制可以用缓慢增长的簇来描述,这些簇在过程的后期阶段之前一直保持孤立,此时添加少量链接会导致这些模块快速互连成一个巨型簇。我们的结果表明,通过复制-发散事件塑造 H-PHN 拓扑的基于进化的过程可能以突然的步骤发生,类似于在一级相变中观察到的情况。
引用
@article{arxiv.0911.4082,
title = {Explosive Percolation in the Human Protein Homology Network},
author = {Hernán D. Rozenfeld and Lazaros K. Gallos and Hernán A. Makse},
journal= {arXiv preprint arXiv:0911.4082},
year = {2015}
}
备注
13 pages, 6 figures