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进化树与 Bethe 晶格上的 Ising 模型:Steel 猜想的一个证明

概率论 2011-09-30 v3 计算工程、金融与科学 数据结构与算法 经典分析与常微分方程 组合数学 统计理论 种群与进化 统计理论

摘要

进化生物学的一项主要任务是从分子数据重建系统发育树。进化模型由树上的马尔可夫链给出。给定马尔可夫链叶节点处的样本,目标是重建带叶标记的树。众所周知,为了重建一棵具有 nn 个叶的树,需要长度为 Ω(logn)\Omega(\log n) 的样本序列。M. Steel 猜想,对于 CFN/Ising 进化模型,如果树上所有边的突变概率小于 p=(21)/23/2p^{\ast} = (\sqrt{2}-1)/2^{3/2},则该树可以从长度为 O(logn)O(\log n) 的序列中恢复。值 pp^{\ast} 由二叉树上 Ising 模型自由 Gibbs 测度极值性的相变点给出。Steel 的猜想已由第二作者在该树“平衡”的特殊情形证明。第二作者还证明了如果所有边的突变概率都大于 pp^{\ast},则所需长度为 nΩ(1)n^{\Omega(1)}。在此我们证明 Steel 的猜想对一般树成立,给出了一个当突变概率离散化且小于 pp^\ast 时从 O(logn)O(\log n) 长度序列恢复树的重建算法。我们的证明与结果表明,无限二叉树上自由 Gibbs 测度的极值性——此前已在概率论、统计物理和计算机科学中被研究——决定了有限二叉树上的 Gibbs 测度可区分的程度。

关键词

引用

@article{arxiv.math/0509575,
  title  = {Evolutionary Trees and the Ising Model on the Bethe Lattice: a Proof of Steel's Conjecture},
  author = {Constantinos Daskalakis and Elchanan Mossel and Sebastien Roch},
  journal= {arXiv preprint arXiv:math/0509575},
  year   = {2011}
}

备注

Second major revision. Updated proofs and statements