折叠分子链着色不变量的增强
几何拓扑
2021-07-21 v1
摘要
折叠的线性分子链在生物学中无处不在。折叠由链内相互作用介导，这些相互作用将链的两个或多个区域“粘合”在一起。由此产生的折叠拓扑被广泛认为决定了生物分子的性质与功能。近年来，纽结理论已被扩展用于描述蛋白质与核酸等折叠线性链的拓扑。为分类和区分链拓扑， quandles 的代数结构已被改造并应用。然而，该方法存在局限，因为明显不同的拓扑可能最终具有相同的着色数。在此，我们通过引入 Boltzmann 权重来增强 quandle 着色方法的分辨能力。我们证明，增强的着色不变量能够以更高的分辨率区分折叠拓扑。
引用
@article{arxiv.2012.00210,
title = {Enhancement of the Coloring Invariant for Folded Molecular Chains},
author = {Jose Ceniceros and Mohamed Elhamdadi and Alireza Mashaghi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2012.00210},
year = {2021}
}
备注
22 pages. 23 figures. Comments are welcome