非阿基米德框架下的Eigen悖论与准物种模型
种群与进化
2022-06-22 v3
摘要
在本文中，我们提出了Eigen-Schuster模型的一种新的p-adic推广，其中基因组（序列）由字母表{0,1,...,p-1}中的单词表示，p为素数，且具有时变长度。序列浓度的时间演化由一个p-adic演化方程控制。序列浓度的长期行为取决于适应度函数f、突变度量Q以及初始浓度分布。该新模型本质上提供了两种类型的渐近演化情景。如果序列复杂性的增长速率合适，那么从长远来看，生存是有保障的。这与更大的基因组尺寸能提高复制保真度的事实相符。在另一种情况下，序列无法以足够高的保真度复制自身，从长远来看将无法生存。Eigen悖论是长期演化中无限多种可能情景之一。这一事实的数学表述需要以严格的数学方式求解p-adic Eigen-Schuster模型的柯西问题。这要求对适应度函数和突变度量等施加限制条件。研究上述初值问题需要过去35年中发展起来的p-adic小波和热核技术。
引用
@article{arxiv.2111.01745,
title = {Eigen's Paradox and the Quasispecies Model in a Non-Archimedean Framework},
author = {W. A. Zúñiga-Galindo},
journal= {arXiv preprint arXiv:2111.01745},
year = {2022}
}
备注
The introduction was modified. The section about the error threshold was modified to avoid substantial text overlap with arXiv:1804.03744