Drugst.One——一种用于在线系统医学与基于网络的药重定位的即插即用解决方案
定量方法
2023-07-06 v2
摘要
近几十年来，新药的开发变得日益昂贵且低效，且大多数药物的分子机制仍知之甚少。为此，计算系统与网络医学工具应运而生，以识别潜在的药重定位候选者。然而，这些工具往往安装复杂，且缺乏直观的可视化网络挖掘能力。为应对这些挑战，我们推出了 Drugst.One，这是一个协助专业计算医学工具转变为用户友好、基于网络的药重定位实用程序的平台。仅需三行代码，Drugst.One 就能将任何系统生物学软件转变为用于建模和分析复杂蛋白-药物-疾病网络的交互式网络工具。为展示其广泛适应性，Drugst.One 已成功与 21 个计算系统医学工具集成。Drugst.One 可在 https://drugst.one 获取，具有简化药物发现过程的巨大潜力，使研究者能专注于药物治疗研究的核心方面。
引用
@article{arxiv.2305.15453,
title = {Drugst.One -- A plug-and-play solution for online systems medicine and network-based drug repurposing},
author = {Andreas Maier and Michael Hartung and Mark Abovsky and Klaudia Adamowicz and Gary D. Bader and Sylvie Baier and David B. Blumenthal and Jing Chen and Maria L. Elkjaer and Carlos Garcia-Hernandez and Mohamed Helmy and Markus Hoffmann and Igor Jurisica and Max Kotlyar and Olga Lazareva and Hagai Levi and Markus List and Sebastian Lobentanzer and Joseph Loscalzo and Noel Malod-Dognin and Quirin Manz and Julian Matschinske and Miles Mee and Mhaned Oubounyt and Alexander R. Pico and Rudolf T. Pillich and Julian M. Poschenrieder and Dexter Pratt and Nataša Pržulj and Sepideh Sadegh and Julio Saez-Rodriguez and Suryadipto Sarkar and Gideon Shaked and Ron Shamir and Nico Trummer and Ugur Turhan and Ruisheng Wang and Olga Zolotareva and Jan Baumbach},
journal= {arXiv preprint arXiv:2305.15453},
year = {2023}
}
备注
45 pages, 6 figures, 7 tables