DNA 作为一维手性材料:在 B 型和 Z 型结构转变中的应用
生物物理
2011-10-06 v3 统计力学
生物大分子
摘要
提出了一个用于 DNA 分子手性变化的动力学模型。该模型是传统弹性模型的扩展,它结合了碱基对的结构,并使用了 DNA 构型的旋量表示以及规范原理。受最近一项关于右旋 B-DNA 和左旋 Z-DNA 之间手性转变的实验 [M. Lee 等人, Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 107, 4985 (2010)] 的启发,我们分析了在施加外部扭矩的线性 DNA 特定情况下的自由能。该模型表明,在低温下,存在一种依赖于施加在 DNA 上的扭矩的快速结构变化,这导致了 B 和 Z 结构域大小的切换。这可以解释实验中观察到的 DNA 延伸长度的频繁切换。
引用
@article{arxiv.1102.3313,
title = {DNA as a one-dimensional chiral material: Application to the structural transition between B form and Z form},
author = {Teruaki Okushima and Hiroshi Kuratsuji},
journal= {arXiv preprint arXiv:1102.3313},
year = {2011}
}
备注
7 pages, 5 figures