蛱蝶科蝴蝶的多样性动态：系统发育不确定性对多样化速率转变估计的影响
种群与进化
2013-02-27 v1
摘要
蛱蝶科 (Nymphalidae) 是真蝴蝶中最大的科，已被用于发展解释植物与昆虫之间进化相互作用的假说。昆虫与寄主植物动态理论预测在某些情景下多样化会加速。我们研究了系统发育不确定性是否影响一种常用方法（MEDUSA，使用逐步 AIC 模拟进化多样性）来估计蛱蝶科谱系中多样化速率的转变，方法是将该方法扩展以在贝叶斯运行后验分布的随机系统发育树样本上运行。我们发现系统发育不确定性极大地影响了多样化速率估计。来自后验分布的不同树对于同一分支群给出的多样化速率范围可从高值到几乎为零，并且对于某些分支群，估计出了显著的速率增加和减少。在最大可信树上发现的 13 个显著转变中，只有 3 个在后验分布超过 95% 的树中是一致的：(i) Ithomiini 族中取食茄科 (Solanaceae) 植物的多样化加速；(ii) Charaxes 属中的多样化加速；以及 (iii) Danaina 亚族中的多样化减速。通过使用二元成种与灭绝模型 (BISSE)，我们发现寄主植物转变为茄科或共同分布的特征是导致 Ithomiini 多样化速率增加的原因，该结果与弥散共物种形成假说一致。转变为夹竹桃科 (Apocynaceae) 并非导致 Danaina 多样化减速的原因。我们的结果表明，在估计多样化速率转变时考虑系统发育不确定性至关重要，仅依赖最大可信树可能会产生错误结果。
引用
@article{arxiv.1302.6294,
title = {Diversity dynamics in Nymphalidae butterflies: Effect of phylogenetic uncertainty on diversification rate shift estimates},
author = {Carlos Peña and Marianne Espeland},
journal= {arXiv preprint arXiv:1302.6294},
year = {2013}
}
备注
23 pages, 7 figures, 2 tables and 12 supplementary material files. Both authors contributed equally to this work