栖息地可变性并不普遍促进苍蝇和哺乳动物代谢网络的模块化
分子网络
2016-01-11 v1
摘要
物种栖息地范围演化是广泛研究领域的重要课题。在高等生物中,栖息地范围演化通常与基因重复等遗传事件相关。然而,在更高生物组织层次(如生化网络)上,决定栖息地可变性的具体因素仍不清楚。从理论和实证分析中得出一个被广泛接受的假设:栖息地可变性促进网络模块化;然而,这种关系在高等生物中尚未直接检验。因此,我利用苍蝇和哺乳动物的化合物与酶网络研究了栖息地可变性与代谢网络模块化之间的关系。与预期相反,栖息地可变性与网络模块化之间没有明显正相关。作为例外,在苍蝇的酶网络中网络模块化随栖息地可变性增加而增加。然而,观察到的关联很可能是人为假象,基因重复的频率似乎是促成网络模块化的主要因素。这些发现提出了在更高层次(即基因尺度以上)是否存在栖息地范围扩张的普遍机制的问题。本研究提示目前广泛接受的栖息地可变性假设应被重新考虑。
引用
@article{arxiv.1512.02826,
title = {Habitat variability does not generally promote metabolic network modularity in flies and mammals},
author = {Kazuhiro Takemoto},
journal= {arXiv preprint arXiv:1512.02826},
year = {2016}
}
备注
21 pages, 4 figures