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真核基因调控中的协同作用:一个病毒实例的物理性质

亚细胞过程 2009-11-13 v1 软凝聚态物质 分子网络

摘要

Epstein-Barr 病毒(EBV)感染了超过 90% 的人类群体,是若干严重与轻微疾病的病原体。它是一种肿瘤病毒,并被广泛用作人类基因(去)调控研究的模型系统。EBV 生命周期的一个核心特征是其能够以被称为潜伏期 I、II 和 III 的状态持续存在于人类 B 细胞中。在潜伏期 III 状态下,宿主细胞被驱动进入细胞增殖,从而扩大病毒群体,但并不进入裂解途径,也不产生新的病毒颗粒;而潜伏期 I 状态则几乎完全处于休眠状态。在本文中,我们研究了一个关于 EBV 在潜伏期 I 与潜伏期 III 之间切换的物理化学模型。我们证明,两种相互竞争的转录因子(一种来自病毒,另一种来自宿主)具有数量异常庞大的结合位点,这使得切换更为陡峭(具有更高的 Hill 系数),其机制既可以是同一物种分子在结合时的协同结合,也可以是当存在足够大的空间位阻时两种物种之间的竞争。

关键词

引用

@article{arxiv.0706.1852,
  title  = {Cooperative action in eukaryotic gene regulation: physical properties of a viral example},
  author = {Maria Werner and LiZhe Zhu and Erik Aurell},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0706.1852},
  year   = {2009}
}

备注

7 pages, 6 figures, 1 table