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与部分相位数据 3D 基因组重建问题相关的欧几里得空间构型

代数几何 2024-05-01 v2

摘要

研究以下问题的动机来自生物学应用;见\cite{cifuentes20233d}。在33维欧几里得空间E3{\bf{E}}^3中,固定六个两两不同的点 \begin{equation*} \label{eqA} \begin{array}{ccc} A=(a_1,a_2,a_3), & B=(b_1,b_2,b_3), & C=(c_1,c_2,c_3), \\ D=(d_1,d_2,d_3), & E=(e_1,e_2,e_3), & F=(f_1,f_2,f_3) \end{array} \end{equation*} 以及E3{\bf{E}}^3中的另外两个点X=(x1,x2,x3)X^*=(x_1^*,x_2^*,x_3^*)Y=(y1,y2,y3)Y^*=(y_1^*,y_2^*,y_3^*)。我们的目标是证明由以下六个关于未知数X=(x1,x2,x3)X=(x_1,x_2,x_3)Y=(y1,y2,y3)Y=(y_1,y_2,y_3)的方程组成的系统()(*) \begin{equation} \label{egy} \frac{1}{\|X-T\|^2} +\frac{1}{\|Y-T\|^2}=\frac{1}{\|X^*-T\|^2} +\frac{1}{\|Y^*-T\|^2}, \quad T\in\{A,B,\ldots,F\}. \end{equation} 在满足以下两个条件时只有有限个解:(i) 固定点A,B,C,D,E,FA,B,C,D,E,F中任意四点不共面;(ii) 六个球心为TT、半径为1/kT1/\sqrt{k_T}的球面中任意四个在E3{\bf{E}}^3中没有公共点,其中 \begin{equation} \label{kxy} k_T=\frac{1}{\|X^*-T\|^2} +\frac{1}{\|Y^*-T\|^2} \end{equation} 此外,我们展示了构型ABCDEFXYABCDEFX^*Y^*,表明条件 (i) 也是必要的。这一结果改进了\cite[Theorem 1]{cifuentes20233d},后者仅在点A,B,,F,X,YA,B,\ldots,F,X^*,Y^*的选择足够通用时才能保证系统()(*)解的有限性。我们还证明了,如果系统()(*)只有有限个解,且将系统()(*)扩展为T{A,B,,F,G}T\in\{A,B,\ldots,F,G\}后存在除(X,Y)(X^*,Y^*)(Y,X)(Y^*,X^*)以外的解,则GG位于一个显式给出的仿射簇WR3W\subsetneqq \mathbb{R}^3上,该簇仅依赖于{A,B,,F}\{A,B,\ldots,F\}。这一结果证明了\cite[Conjecture 1]{cifuentes20233d}。

关键词

引用

@article{arxiv.2403.00407,
  title  = {Configurations in the Euclidean space related to the 3D genome reconstruction problem from partially phased data},
  author = {Annachiara Korchmaros},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2403.00407},
  year   = {2024}
}

备注

14 pages