肌球蛋白结合蛋白 C 的 C5 结构域折叠与突变特性的计算分析

Carlo Guardiani; Fabio Cecconi; Roberto Livi

肌球蛋白结合蛋白 C 的 C5 结构域折叠与突变特性的计算分析

基因组学 2007-12-11 v1 软凝聚态物质统计力学生物大分子

作者: Carlo Guardiani , Fabio Cecconi , Roberto Livi

摘要

采用以天然结构为中心的模型，对肌球蛋白结合蛋白 C（Myosin Binding Protein C）的 C5 结构域进行了热折叠分子动力学（Molecular Dynamics）模拟，以研究与家族性肥厚型心肌病相关的三种突变的作用。Asn755 的突变导致折叠温度发生最大偏移，该残基位于具有最高 $\Phi$ 值的 CFGA' $\beta$ -折叠片中。因此，该突变似乎降低了热力学稳定性，这与实验数据一致。相反，Arg654 和 Arg668 的突变引起的折叠温度变化很小，且它们位于低 $\Phi$ 值的 BDE $\beta$ -折叠片中，因此其病理作用不能归因于折叠过程的受损，而可能与靶分子的结合有关。鉴于 C5 结构域的典型特征是与其他 Ig 样结构域相比存在一个更长且不稳定的 CD 环，我们完成了对该环的生物信息学分析，显示其具有高负电荷密度和低疏水性。这表明 CD 环是一个天然无序序列，其折叠与配体结合之间可能存在耦合。

关键词

分子动力学模拟蛋白质折叠家族性肥厚型心肌病肌球蛋白结合蛋白 C 以天然结构为中心的模型 $\Phi$值天然无序序列

引用

@article{arxiv.0712.1554,
  title  = {Computational analysis of folding and mutation properties of C5 domain from Myosin binding protein C},
  author = {Carlo Guardiani and Fabio Cecconi and Roberto Livi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0712.1554},
  year   = {2007}
}

备注

RevTeX, 10 pages, 9 eps-figures

肌球蛋白结合蛋白 C 的 C5 结构域折叠与突变特性的计算分析

摘要

关键词

引用

备注

相关论文