整合酶（一类改变DNA拓扑结构的蛋白质）的缠结方程解的分类
几何拓扑
2007-05-23 v1 生物大分子
摘要
作用于环状双链 DNA 的整合酶蛋白常通过把无结圆转化为环面结与链环来改变其拓扑结构。对此变换建模时，会出现两套缠结方程组——对应于两条初始 DNA 序列——即正向与反向系统。在对组成缠结不作先验假设的情况下，我们利用 Dehn 手术论证完整分类了这两套系统中各自的缠结解。关键一步是将我们此前论文的工作与 Kronheimer、Mrowka、Ozsvath、Szabo 及 Ernst 近期的结果相结合，证明某个素缠结事实上必为广义 Montesinos 缠结。这些缠结解被划分为三类（两套系统共有），外加反向系统的第四类，其中含有唯一的广义 Montesinos 缠结。我们讨论了该分类及这一新解可能的生物学意义。
引用
@article{arxiv.math/0501173,
title = {Classification of Tangle Solutions for Integrases, A Protein Family that Changes DNA Topology},
author = {Dorothy Buck and Cynthia Verjovsky Marcotte},
journal= {arXiv preprint arXiv:math/0501173},
year = {2007}
}
备注
17 pages, 1 figure