DNA 分子相互作用体系中的气泡合并
统计力学
2022-11-08 v1
摘要
我们考虑两种相互作用 DNA 分子的模型：其一为相互作用 DNA 中的（四参数）气泡合并模型（简称：BCI-DNA）；其二为凝聚态 DNA 分子中的（三参数）气泡合并模型（简称 BCC-DNA）。为研究 BCI-DNA 与 BCC-DNA 模型的气泡合并热力学，我们采用统计物理方法。具体而言，我们定义各模型的哈密顿量并给出其平移不变吉布斯测度（TIGM）。对第一个模型，我们找到使相应哈密顿量具有多达三种 TIGM（系统的三相）的参数，其生物学意义对应三种状态的存在：“无气泡合并”、“软区主导”与“气泡合并”。对第二个模型，我们证明对任意（容许）参数该模型均具有唯一的 TIGM。这是一种“无气泡合并”相占主导的状态。
引用
@article{arxiv.2211.03106,
title = {Bubble coalescence in interacting system of DNA molecules},
author = {U. A. Rozikov},
journal= {arXiv preprint arXiv:2211.03106},
year = {2022}
}
备注
16 pages, 4 figures. arXiv admin note: text overlap with arXiv:2006.13828, arXiv:1606.02061