评估 T 细胞克隆大小分布：一种非参数方法
定量方法
2014-10-07 v2
摘要
人类外周 T 细胞库的克隆结构由多种稳态机制塑造，包括抗原呈递、细胞因子和细胞调控。其精确调节导致了对抗各种病原体的卓越能力，而系统性失败可能导致自身免疫性疾病等严重后果。在此，我们开发并利用一种非参数统计方法，基于最新的下一代测序数据评估 T 细胞克隆大小分布。对于 41 名健康个体和一名接受治疗的强直性脊柱炎患者，我们 invariably 发现在数个数量级上存在幂律缩放，并首次定量计算了具有意义的衰减指数值。事实证明，该值在健康供体中基本相同，在自身免疫患者治疗前显著不同，而在治疗后收敛于典型值。我们讨论了这些发现对适应性免疫的理论理解和数学建模的启示。
引用
@article{arxiv.1404.6790,
title = {Assessing T cell clonal size distribution: a non-parametric approach},
author = {O. V. Bolkhovskaya and D. Yu. Zorin and M. V. Ivanchenko},
journal= {arXiv preprint arXiv:1404.6790},
year = {2014}
}
备注
13 pages, 3 figures, 2 tables