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生命早期印记 T 细胞克隆大小的层级结构

种群与进化 2021-01-06 v1 基因组学

摘要

适应性免疫系统通过选择具有特异性受体的细胞克隆来应对病原体。尽管针对特定抗原的克隆选择已被详细研究,但尚不清楚一生中对多种抗原的暴露如何共同塑造免疫组库。在此,通过数学建模与 T 细胞受体测序数据的统计分析,我们证明围产期时间窗口内的克隆扩增对人类 T 细胞组库留下了持久的印记。我们展示了描述最大克隆的秩与其大小关系的经验标度律如何源于组库形成过程中的克隆生长。我们在统计上识别出早期建立的克隆,并发现它们确实在最大克隆中高度富集。这种富集即使在数十年的人类衰老之后依然持续,其方式可由波动克隆选择模型定量预测。我们的工作提出了一种与人类组库组织的统计规律相容的 T 细胞动力学定量理论,并提供了一种早期克隆动力学如何印记 T 细胞克隆大小层级结构的机制,这对病原体防御与自身免疫具有启示意义。

关键词

引用

@article{arxiv.2007.11113,
  title  = {Early life imprints the hierarchy of T cell clone sizes},
  author = {Mario U. Gaimann and Maximilian Nguyen and Jonathan Desponds and Andreas Mayer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2007.11113},
  year   = {2021}
}

备注

8 pages, 4 figures + 27 pages supplement with 20 figures