分析 SARS-CoV-2 宿主-病毒相互作用组以识别 COVID-19 发病过程中的易感宿主蛋白
生物大分子
2021-05-19 v1 机器学习
摘要
COVID-19 治疗靶点的开发基于对发病机制分子机制的理解。识别参与感染机制的基因和蛋白质是阐明复杂分子机制的关键。世界各地许多实验室的共同努力使得蛋白质和遗传相互作用数据的积累成为可能。在这项工作中，我们整合了这些可用结果，获得了一个由 1432 个人类蛋白质组成的宿主蛋白质-蛋白质相互作用网络。我们计算网络中心性度量以识别关键蛋白，随后对中心蛋白进行功能富集分析。我们观察到所识别的蛋白大多与若干关键通路相关，包括细胞过程、信号转导、神经退行性疾病。最后，我们聚焦于参与引起人类呼吸道疾病的蛋白。我们得出结论，COVID-19 是一种复杂疾病，并强调了许多潜在治疗靶点，包括 RBX1、HSPA5、ITCH、RAB7A、RAB5A、RAB8A、PSMC5、CAPZB、CANX、IGF2R、HSPA1A，它们处于中心位置且与多种疾病相关。
引用
@article{arxiv.2102.03253,
title = {Analyzing Host-Viral Interactome of SARS-CoV-2 for Identifying Vulnerable Host Proteins during COVID-19 Pathogenesis},
author = {Jayanta Kumar Das and Swarup Roy and Pietro Hiram Guzzi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2102.03253},
year = {2021}
}