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易受多种生物体攻击的人类蛋白质鉴定及其疾病关联

分子网络 2016-09-13 v1

摘要

尽管大多数研究强调病原体-宿主相互作用 (PHI) 的某些方面,例如细菌或病毒对其人类受体同源物的优先结合,但也有研究尝试系统地对病原体蛋白与其宿主蛋白之间的相互作用进行分类。在此,我们分析了来自病原体-宿主相互作用搜索工具 (PHISTO) 的 182 种病原体,并能够鉴定出同时作用于病毒和细菌的蛋白质/蛋白质编码基因。重要的是,有少数蛋白质更容易受到细菌和病毒病原体的攻击,即 P53(肿瘤蛋白 p53)、NFKB1(B细胞中 kappa 轻多肽基因增强子核因子 1)、GBLP(鸟嘌呤核苷酸结合蛋白亚基 beta-2-like-1)、TOX4(TOX 高迁移率族盒家族成员 4)、PDIA1(蛋白质二硫键异构酶前体)、MHY9(肌球蛋白 9)、RAC1(Ras 相关 C3 肉毒杆菌毒素底物 1)、CCAR2(细胞周期与凋亡调节蛋白 2)和 ILF3(白细胞介素增强子结合因子 3)。鉴定此类重要相互作用蛋白 (IIP) 可以为更好地理解此类与人类宿主相互作用的病原体的分子机制提供重要见解。

关键词

引用

@article{arxiv.1609.03337,
  title  = {Identification of Human Proteins vulnerable to multiple Organisms and their disease associations},
  author = {S. Chatterjee and B. S. Sanjeev},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1609.03337},
  year   = {2016}
}

备注

7 pages, 3 figures, Conference version in the Proceedings of the International Conference on Bioinformatics and Systems Biology (BSB), 4-6 March 2016