人类癌症分子通路网络的代数与拓扑指数
分子网络
2014-05-08 v1
摘要
与疾病相关的蛋白质 - 蛋白质相互作用网络已成为一个突出的研究领域。我们研究了源自京都基因与基因组百科全书 (KEGG) 数据库的 11 种人类癌症的蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的代数指数和拓扑指数。我们发现，相对自同构群大小和拓扑网络复杂度一方面与五年生存概率另一方面之间存在强相关性。此外，我们识别出几个在多种癌症通路中重复出现的蛋白质家族（例如 PIK、ITG、AKT 家族）。有趣的是，这些对称性来源通常处于中心位置而非边缘位置。我们的结果有助于识别有前景的抗癌药物靶点。除此之外，我们提供了一个统一框架来研究相关疾病家族（例如神经退行性疾病、病毒性疾病、物质滥用障碍）的蛋白质 - 蛋白质相互作用网络。
引用
@article{arxiv.1405.1462,
title = {Algebraic and Topological Indices of Molecular Pathway Networks in Human Cancers},
author = {Peter Hinow and Edward A. Rietman and Jack A. Tuszynski},
journal= {arXiv preprint arXiv:1405.1462},
year = {2014}
}
备注
15 pages, 4 figures