人类 Sirtuin 家族的蛋白质 - 蛋白质相互作用网络

蛋白质 - 蛋白质相互作用网络有助于研究人类疾病，并通过整体方法寻找可能的医疗保健途径。网络在理解稳态、信号传导、时空组织等生理过程以及病理状态方面发挥着日益重要的作用。在本文中，我们展示了由人类 Sirtuins (Sirt) 决定的复杂相互作用系统，Sirtuins 广泛参与许多代谢过程以及多种疾病。Sirtuin 家族由七个同源的 Sirt 蛋白组成，它们具有结构相似的核心，但末端片段不同，长度变化较大且/或本质无序。许多研究已确定了它们的细胞定位及生物学功能，但其作用的分子机制实际上知之甚少。因此，本工作的目的是定义、探索和理解 Sirtuin 相关的人类相互作用组。作为第一步，我们将实验确定的 Sirtuin 家族蛋白质 - 蛋白质相互作用及其第一和第二邻域整合到一个 Sirtuin 相关的子相互作用组中。我们的数据显示，Sirtuins 的第二邻域网络涵盖了整个人类相互作用组的 25%，呈现出无标度度分布以及高度节点间的互联性。此外，Sirtuin 子相互作用组显示出围绕核心的模块化结构，包含混合功能。最后，我们从 Sirtuin 子相互作用组中提取了与癌症、衰老和翻译后修饰相关的子网，以获取关于 Sirt 家族网络中子网的关键节点和拓扑空间的信息。