利用全基因组基因分型数据分析法国野猪种群的杂交情况
种群与进化
2021-12-17 v1
摘要
自20世纪80年代以来，基于野猪与家猪之间的细胞遗传学差异（分别为36和38条染色体），法国野猪种群的“遗传纯度”一直受到监测。这一差异使得任何具有37或38条染色体的野猪被识别为“杂交”个体，但无法判定杂交的来源（近期或古老），也不能保证具有36条染色体动物的“纯度”。对过去12年间超过4,600次检测结果的统计分析显示平均“杂交”率为15.8%，且种群间差异很大。为更详细地分析杂交并克服细胞遗传学方法固有的局限性，对近期在法国不同地区采集的362头野猪使用70K SNP（GeneSeek GGP Porcine HD）芯片进行基因分型。该研究表明，在所分析的野猪中，96.4%（包括大多数具有37或38条染色体的个体）的“家猪”来源基因组比例在0至18%之间。这表明杂交是一种相当常见但强度适中且往往古老的现象。然而，在如阿尔代什等一些地区观察到较高的杂交率，并且在3.6%的被分析野猪中发现若干近期与家猪杂交的个案，其中多数涉及亚洲来源的家猪。
引用
@article{arxiv.2112.08876,
title = {Analysis of hybridization in French wild boar populations using genome-wide genotyping data},
author = {Nicolas Mary and Nathalie Iannuccelli and Geoffrey Petit and Nathalie Bonnet and Alain Pinton and Vladimir Grosbois and Bertrand Servin and Juliette Riquet and Alain Ducos},
journal= {arXiv preprint arXiv:2112.08876},
year = {2021}
}
备注
in French. Journ{\'e}es de la Recherche Porcine en France, 2021