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全原子模拟揭示单点突变如何促进丝氨酸蛋白酶抑制剂错误折叠

生物大分子 2018-06-19 v2 软凝聚态物质 生物物理

摘要

蛋白质错误折叠与许多疾病有关,包括丝氨酸蛋白酶抑制剂病(serpinopathies)。对于典型抑制性丝氨酸蛋白酶抑制剂 {\alpha}1-antitrypsin (A1AT),突变可导致蛋白质缺乏引起肺病,错误折叠突变体可在肝细胞中积累导致肝病。利用基于最近开发的 Bias Functional 算法的全原子模拟,我们阐明了野生型 A1AT 如何折叠以及疾病相关的 S (Glu264Val) 和 Z (Glu342Lys) 突变如何导致错误折叠。有害的 Z 突变在早期破坏折叠,而相对良性的 S 突变显示晚期轻微错误折叠。许多抑制突变缓解 Z 突变的影响,对这些突变体的模拟有助于阐明在 Z 错误折叠中空间位阻冲突和静电相互作用的相对作用。这些结果展示了原子事件与疾病严重性之间的显著相关性,并揭示了将链偏离正确折叠路径的机制。

关键词

引用

@article{arxiv.1707.05019,
  title  = {All-atom simulations reveal how single point mutations promote serpin misfolding},
  author = {Fang Wang and Simone Orioli and Alan Ianeselli and Giovanni Spagnolli and Silvio a Beccara and Anne Gershenson and Pietro Faccioli and Patrick L. Wintrode},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1707.05019},
  year   = {2018}
}

备注

Final version. Supplementary Information included