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DNA分子中庞加莱回归的代数统计

生物大分子 2015-11-04 v1 统计力学

摘要

研究了在具有数千自由度的真实水溶液环境中,全原子DNA分子碱基对呼吸动力学的庞加莱回归统计。发现至少在五个时间数量级上,回归的衰减由代数律描述,庞加莱指数接近β=1.2\beta=1.2。该值与时间分辨斯托克斯位移实验中观察到的关联衰减指数ν=β1\nu = \beta -1(接近ν0.15\nu\approx 0.15)直接相关。通过应用维里定理,我们分析了多项式势中的混沌动力学,并解析证明,假设偶极-偶极相互作用在相关DNA动力学中占主导地位时,可获得指数β=1.2\beta=1.2。分子动力学模拟还揭示了指数为η=1.6\eta=1.6的强低频噪声的存在。我们追踪了与具有少数自由度的辛映射混沌动力学的相似之处,其特征为庞加莱指数β1.5\beta \sim 1.5

关键词

引用

@article{arxiv.1508.01911,
  title  = {Algebraic statistics of Poincar\'e recurrences in DNA molecule},
  author = {Alexey K. Mazur and D. L. Shepelyansky},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1508.01911},
  year   = {2015}
}

备注

5 pages, 4 figures