Cryo-EM 中公共线的代数约束与算法
最优化与控制
2024-06-10 v3 代数几何
摘要
我们重新审视单颗粒冷冻电子显微镜中投影图像间公共线的主题。对于一个分子构象的 张投影图像，在存储其公共线经适当缩放基向量的某个 矩阵上，我们推导出一种新颖的低秩约束。利用该代数约束及其他约束，我们给出了对公共线去噪并恢复与图像相关联的未知 3D 旋转的优化算法。作为应用，在 cryo-EM 中存在离散异质性的情况下，我们开发了一种聚类算法，利用公共线将一组含噪图像划分为同质社区。我们在合成和实验数据集上验证了这些方法。
引用
@article{arxiv.2403.16879,
title = {Algebraic Constraints and Algorithms for Common Lines in Cryo-EM},
author = {Tommi Muller and Adriana L. Duncan and Eric J. Verbeke and Joe Kileel},
journal= {arXiv preprint arXiv:2403.16879},
year = {2024}
}