基于共线条的循环对称分子从头建模方法
计算几何
2020-01-08 v3 数值分析
数值分析
计算物理
摘要
冷冻电子显微镜中单颗粒重构的挑战之一是利用分子的二维含噪投影图像求得其三维修模。本文针对具有重循环对称性的分子，提出了一种鲁棒的“角度复原”算法，用于估计投影图像的方向参数。我们提出的方法利用自共线条，其在每个投影图像的傅里叶变换中诱导出相同直线。我们表明，自共线条的位置具有若干有利的几何约束，从而即使在含噪环境下也能检测它们。此外，对于具有更高阶旋转对称性的分子，我们提出的方法利用了此类分子任意两个傅里叶变换投影图像之间存在大量共线条这一事实，从而即使在高噪声水平下也能确定它们的相对方向。我们通过针对模拟和实验数据进行的数值实验证明了所提方法的有效性。
引用
@article{arxiv.1901.10888,
title = {A common lines approach for ab-initio modeling of cyclically-symmetric molecules},
author = {Gabi Pragier and Yoel Shkolnisky},
journal= {arXiv preprint arXiv:1901.10888},
year = {2020}
}