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基于概率PCA的冷冻电镜无监督颗粒筛选

图像与视频处理 2023-03-08 v2 信号处理

摘要

单颗粒冷冻电子显微镜(cryo-EM)是解析分子结构的主流技术。在该流程早期,用户从原始数据中检测潜在颗粒图像。通常由于高噪声与污染水平会产生大量误检。目前,去除误检需人工干预以筛选数十万张图像。我们提出一种基于统计建立的无监督算法来去除非颗粒图像。我们将颗粒图像建模为低维子空间的并集,假设非颗粒图像在高维空间中任意散布。该算法基于概率 PCA 框架的扩展,以鲁棒地学习子空间并集的非线性模型。这为 cryo-EM 数据提供了灵活模型,并允许自动去除对应纯噪声与污染的图像。数值实验证实了该筛选算法的有效性。

关键词

引用

@article{arxiv.2210.12811,
  title  = {Unsupervised particle sorting for cryo-EM using probabilistic PCA},
  author = {Gili Weiss-Dicker and Amitay Eldar and Yoel Shkolinsky and Tamir Bendory},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2210.12811},
  year   = {2023}
}